Ele possui uma das maiores extensões preservadas de Mata Atlântica original, além de ter uma das maiores concentrações de cavernas do planeta.

O PETAR possui aproximadamente 36.000 hectares de cobertos por uma dos últimos remanescentes da Mata Atlântica no estado de São Paulo. Suas montanhas, vales, cachoeiras, rios de águas cristalinas, cavernas, fauna e flora exuberantes tornaram o PETAR um ponto muito importante para o ecoturismo brasileiro. A presença das cavernas em conjunto com a Mata Atlântica preservada propicia ao visitante conhecer diversos ambientes, passar por alguns obstáculos, tomar banho de cachoeiras fora e dentro de cavernas, gerando experiências que ao retornar a sua origem ele tem uma feliz sensação de ter conhecido um lugar maravilhoso. Sua grande diversidade de roteiros permite agradar desde aos iniciantes até aos veteranos.

O PETAR possui quatro “Núcleos” para a visitação turística: Núcleo Santana, Núcleo Ouro Grosso, Núcleo Casa de Pedra, Núcleo Caboclos. Os mais freqüentados são o Núcleo Santana e o Núcleo Ouro Grosso.

Caverna Casa de Pedra
Localizada no Núcleo Casa de Pedra do PETAR. Esta caverna é conhecida pela exuberância de sua entrada. Seu pórtico alcança 215m de altura. Seu salão principal de 350m de comprimento, 120m de larguda e 70m de altura é iluminado por uma grande boca seca. Após a galeria seca existe um trechoi de natação, com 25m de comprimento e forte correnteza. Aqui pode-se escalar os íngremes paredões com auxílio de equipamento adequado.
Acesso: Em Apiaí dirija-se para a SP-250 e na altura do Km 30 dessa rodovia (placa "Espírito Santo") siga à direita em estrada de terra. Depois de 16Km chega-se ao Núcleo Cablocos do PETAR, onde deve-se dirigi à administração que indicará os roteiros. Só pode ser visitada com monitores especializados e a travessia ocorre apenas com autorização especial.

Caverna da Água Suja
Localizada no Núcleo Santana do PETAR, esta caverna é composta essencialmente de um rio subterrâneo, que recebe dois afluentes. Sua entrada tem teto bastante alto e aproximadamente 10m de largura. Seguindo-se a galeria do rio, o caminho dificulta-se pelo teto baixo, onde deve-se tomar cuidado com súbitas enchentes.
Acesso: junto ao Km 21 da estrada que liga os municípios de Apiaí e Iporanga, sai uma variante à esquerda, sinalizada, que leva após 1,2 Km à área do estacionamento do parque. Do estacionamento segue-se uma trilha acompanhando o curso do rio Betari, com trechos bastante íngremes. Depois de 1300m encontra-se um acesso de mais 50m à direita que leva a essa caverna. Visita somente com autorização. Cobrança de ingresso no Núcleo.

Caverna da Arataca
Localizada no Núcleo Caboclos do Petar, a caverna da arataca possui três entradas diferentes, sendo a inferior o acesso mais habitual. Depois de 250m no interior da caverna, chega-se a uma entrada, no outro lado da montanha. O teto é baixo na entrada principal mas logo abra-se o salão. Existem muitos trechos com teto baixo, argila, quebra-corpos e aclives com chaminés.
Acesso: Em Apiaí dirija-se para a SP-250 e na altura do Km 30 dessa rodovia (placa “Espírito Santo”) siga à direita em estrada de terra. Depois de 16 Km chega-se ao Núcleo Caboclos do PETAR, onde deve-se dirigir à administração que indicará os roteiros. Visita somente com autorização.

Caverna de Santana
Localizada no Núcleo Santana do PETAR, é a mais visitada do Estado de São Paulo. Rica em formações e labirintos, é constituída por uma malha de galeria em três níveis, depois em apenas duas sobrepostas, por onde escoa o rio Roncador. Parte desta caverna é de fácil acesso, com escada de madeira e pontes construídas nos pontos de difícil travessia. Outra só pode ser visitada com a ajuda de guias altamente especializados. Por fim, uma terceira parte é acessível somente a especialistas e com autorização prévia.
Acesso: junto ao Km 21 da estrada que liga os municípios de Apiaí e Iporanga, sai uma variante à esquerda sinalizada, que leva após 1,2 Km à área de estacionamento do parque. Ali existem placas indicativas para chegar na caverna. Visita somente com autorização. Cobrança de ingresso no Núcleo.

Caverna do Monjolinho
Localizada no Núcleo Caboclos do PETAR, a caverna do Monjolinho tem 350m de desenvolvimento e percurso totalmente seco. O ribeirão do Monjolinho atravessa a caverna num nível inferior, o que faz perceptível apenas pelo barulho de suas águas. Dentre suas formações, destaca-se a coluna conhecida como “Gigante do Monjolinho”. Os espeleotemas não estão em bom estado de conservação e é necessário cuidado em certos trechos.
Acesso: Em Apiaí dirija-se para a SP-250 e na altura do Km 30 dessa rodovia (placa “Espírito Santo”) siga à direita em estrada de terra. Depois de 16 Km chega-se ao Núcleo Caboclos do PETAR, onde deve-se dirigir à administração que indicará os roteiros. Visita somente com autorização.

Caverna do Couto
Localizada logo abaixo da Caverna do Morro Preto, no Núcleo Santana do PETAR, essa caverna atravessa a montanha. Ao lado de uma de suas entradas encontra-se uma cachoeira com a água que vem de dentro da caverna e deságua no Rio Betari alguns metros abaixo. Em alguns trechos o teto é relativamente baixo e sua visão é muito interessante com gotículas penduradas refletindo as luzes das lanternas. Não possui ornamentações, sendo 400m o seu desenvolvimento.
Acesso: junto ao Km 21 da estrada que liga os municípios de Apiaí e Iporanga, sai uma variante à esquerda sinalizada, que leva após 1,2 Km à área de estacionamento do parque. Ali existem placas indicativas para chegar na caverna. Visita somente com autorização. Cobrança de ingresso no Núcleo. 

Caverna do Morro Preto
Localizada no Núcleo Santana do PETAR. Sua entrada é muito bonita. Apresenta amplas galerias e salões, de fácil travessia. Em apenas dois locais existem desníveis de no máximo 5 metros, superados por escadas de madeira. Em uma de suas salas foram encontrados vestígios de habitação pre-histórica.
Acesso: junto ao Km 21 da estrada que liga os municípios de Apiaí e Iporanga, sai uma variante à esquerda sinalizada, que leva após 1,2 Km à área de estacionamento do parque. Ali existem placas indicativas para chegar na caverna que está a 500m do quiosque de recepção. Deve-se atravessar o rio Betari e seguir por uma trilha. Visita somente com autorização. Cobrança de ingresso no Núcleo.